MES ACTIVITES

par profession et par plaisir


Depuis le 1er juillet 2001, j'occupe une position de Chargé de Recherche à l'INRA. Avant cela, ma formation a consisté en un parcours relativement classique (j'entends par là, le cursus universitaire du DEUG au Doctorat). Ci-dessous en est donné très brièvement le détail. Pour un CV plus complet (document PDF téléchargeable) cliquer ici. En 2005, j'ai obtenu le diplôme universitaire d''Habilitation à Diriger des Recherches de l'Université de Savoie (le 22 septembre). On peut lire mes dossiers d'inscription et de candidature en suivant les liens. En juillet 2005, je suis passé du grade de CR2 à CR1. Pour un bilan complet de mes activités entre 2001 et 2005, il faut lire ce document. Mon dernier rapport d'évaluation date de 2007 et il est également consultable.

L'agenda de mes déplacements/disponibilités peut être consulté en suivant ce lien.


  • 2005 Habilitation à Diriger les Recherches (HDR), Université de Savoie
  • Depuis juillet 2001 Chargé de Recherche à l'INRA de Thonon-les-Bains (CARRTEL)
  • 2000-2001 Post-doctorat à l'Université de Bergen (Norvège)
  • 1996-2000 THESE d'Océanologie Biologique de l'Université Paris VI (Station Biologique de Roscoff)
  • 1995-1996 D.E.A. d'Océanologie Biologique (Université Pierre et Marie Curie, Paris 6)
  • 1993-1994 A.E.A. d'Océanologie Biologique (Université Pierre et Marie Curie, Paris VI)
  • 1992-1993 MAITRISE de Biologie des Organismes et des Populations de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris VI)
  • 1991-1992 LICENCE de Biologie des Organismes de l'Université Pierre et Marie Curie (Paris VI)
  • 1989-1991 D.E.U.G. de Biologie de l'Université de Nice Sophia-Antipolis
  • 1998-1989 BACCALAUREAT série D (Maths, Physique, Biologie), Lycée Carnot, (Cannes)


    A la Station INRA d'Hydrobiologie Lacustre de Thonon-les-Bains, dont vous connaitrez bientôt toute l'histoire si cela vous intéresse, notre équipe de recherche s'intéresse à la dynamique, à la diversité, au rôle fonctionnel et à l'évolution des communautés microbiennes planctoniques. Notre expertise porte, entre autre et depuis longtemps, sur l'écologie des cyanobactéries. Un premier objectif fondamental et historique de notre équipe a été de mieux comprendre la biologie et l'écologie d'espèces cyanobactériennes qui sont responsables d'efflorescences. La figure ci-contre est une photo (G Paolini) de Planktothrix rubescens, connu localement sous le vocable "sang des Bourguignons". Il s'agit d'une cyanobactérie filamenteuse toxique qui prolifère depuis quelques années sur le lac du Bourget de manière relativement pérenne. En cliquant sur le lien de la Station ou sur le lien "thématique de recherche de l'équipe", vous trouverez des informations sur la Biologie et l'Ecologie des Cyanobactéries Filamenteuses Toxiques, les programmes de recherches initiés ou en cours auxquels collaborent notre groupe. L'historique de la Station lacustre ainsi que les différentes équipes qu'elle abrite actuellement sont présentés. Il est important de noter ici que cette thématique sera peut-être amenée à devenir de moins en moins importante dans les années à venir. Si vous voulez tout savoir sur le suivi (le plus récent et le plus complet, élaboré en 2006) de la qualité des eaux du lac du Bourget, un de nos terrains de jeu privilégié, il faut cliquer . Vous trouverez dans ce rapport tout un dossier concernant P. rubescens.

    Notre équipe de recherche s'est aggrandie en 2002 en "fusionnant" avec des collègues universitaires de la technopole chambérienne si bien que nous sommes devenus (entre 2003 et 2007 inclus) l'Equipe d'Ecologie Microbienne Aquatique. Nous nous sommes alors intéressés à l'écologie des micro-organismes aquatiques: des virus aux protistes. Pourquoi s'intéresser aux communautés microbiennes ? Tout simplement parce qu'elles sont à la base du réseau trophique pélagique, que leur diversité est très importante et que l'on sait très peu de choses sur elles au niveau fonctionnel à ce jour pour les lacs péri-alpins. De plus, les systèmes étudiés sont soit oligotrophe (lac d'Annecy) soit tendent vers cette situation trophique (lac du Bourget et lac Léman). Ce que l'on voit, ce que l'on sait et ce que l'on est en droit d'attendre, c'est :- l'augmentation progressive de l'importance relative du compartiment picoplanctonique à la biomasse phytoplanctonique à plus ou moins court-terme; - et comme voie de conséquence, l'augmentation du rôle de la boucle microbienne dans le transferts des flux de matière vers les niveaux trophiques supérieurs. Dans ce contexte, un intérêt tout particulier est porté sur l'importance quantitative et fonctionnelle des virus de bactéries (projet ANR ayant démarré début 2008). Depuis 2008, nous nous intéresserons aussi aux virus de microalgues (Postdoc de 2 ans débuttant en décembre). Notons enfin que 2008 a aussi été une année de changement avec une restructuration de notre unité de recherche et de l'équipe EMA. Aujourd'hui, j'appartiens à l'équipe BioFEEL (Biodiversité, Fonctionnement et Evolution des Ecosystèmes Lacustres). En 2002, j'ai mis en place une animation scientifique au sein de la Station consistant pour des chercheurs, locaux ou invités, étudiants ou confirmés, à exposer leurs travaux de recherche. Cette manifestation baptisée "Les Séminaires de la SHL" connait un beau succès et une fenêtre INTERNET lui est dédiée avec les présentations en ligne des intervenants. Je vous invite à y faire un tour pour voir les exposés passés et à venir. Mieux que cela; si vous passez par Thonon et que vous êtes disposé(e) à nous présenter une communication orale, prenez contact avec moi ou avec Rémy Tadonléké (tadonleke@thonon.inra.fr), le nouvel animateur depuis septembre 2005. Avec mon directeur d'unité (Jean-Marcel Dorioz, DR2) et une collègue chercheuse (Orlane Anneville, CR2), je co-anime le projet de création d'un Observatoire de Recherche intitulé : OR Lacs subalpins: structure, fonctionnement et évolution écologique des grands lacs subalpins sous influence anthropique. L'objectif général de ce projet est d'étudier, comprendre et in fine modéliser les dynamiques d'écosystèmes lacustres soumis à une évolution (en nature et en intensité) des pressions d'anthropisation (pollution, urbanisation) et du climat. A la fin de l'année 2005, nous avons mis en chantier le rattachement de cet ORE à la Zone Atelier du Bassin du Rhone ZABR et à la plateforme régionale Envirhonalpes. Enfin, l'édification d'une énorme base de données lacustres est en cours de réalisation. Le projet final a été déposé au mois d'avril 2007. Il a été labellisé par l'INRA en janvier 2008 et une réunion de travail a été programmée pour le 25 novembre 2008. Je me suis beaucoup investit pendant toute l'année 2004 dans l'organisation et la mise en place d'un congrès international qui a eu lieu à Thonon du 2 au 4 février 2005. Il s'est agit du "1st European Workshop on Aquatic Phage Ecology". Pour tout savoir sur cet événement et si l'anglais n'est pas un problème pour vous, je vous invite à suivre le lien suivant: EWAPE-1. Un site Internet relatif au réseau français d'écologie virale aquatique est encours de construction. L'année 2005 a été l'occasion d'organiser et animer un nouveau colloque (national, cette fois-ci) intitulé "Autour du lac du Bourget". Un livre vient d'être édité à la fin de l'année 2008 sous la forme d'actes de ce colloque. Pour tout savoir sur le suivi de la qualité des eaux du lac du Bourget, il l faut lire ce rapport très complet pour les années 2004-2005 (en lien avec le passé) puis les rapports des années suivantes, 2006 et 2007. En 2010, j'animerai le 52ème congrès de l'AFL (Association Française de Limnologie), le diaporama vous présentant le dossier de candidature présenté au CA de l'AFL à Rouen en octobre 2008. Depuis la fin de l'année 2005, j'ai été nommé membre externe de la Commission de Spécialistes de l'Université de Savoie pour les sections 64 à 68. Cette commission juge les candidatures aux postes de maitre de conférences et d'Attachés Temporaires à l'Enseignement et à la Recherche (ATER). Enfin, au sein de mon unité de recherche, j'appartiens à un certain nombre de groupes de travail qui oeuvre à l'amélioration/perfectionnement de tout ce qu'il est possible d'améliorer/perfectionner !!! Ces activités ont porté ou portent par exemple sur l'INTERNET, la bibliothèque, la base de données lacustres BADEL, la base de données "algothèque", la plateforme expérimentale Mésocosmes, etc


    La pratique de la plongée en mer ou en lac comme formateur ou pour mon propre plaisir a été et reste en partie une activité maîtresse dans ma vie. Le lien ci dessous vous renvoie sur une page 'Plongée' où il est question de ma formation, de mes activités, de mes publications et l'accès à d'autres informations ou liens. Une attention plus particulière est portée sur la plongée scientifique (de quoi s'agit-il ? quel intérêt ? a qui est-elle destinée ? qui en sont les acteurs ?). A ce sujet, notez que j'ai organisé le 22ème stage de formation à l'habilitation de chef de plongée scientifique du CNRS qui a eu lieu du 1 au 12 septembre 2008 dans la rade de Villefranche-sur-mer et que j'ai demandé à intégrer le Comité National de la Plongée Scientifique.